El Programa será ejecutado mediante Planes Anuales de Operación (PAO), que se acordarán con el Banco en reuniones anuales de seguimiento, como se señala más adelante.
La dirección estratégica del Programa corresponderá a la SCJ, la cual aprobará, mediante resolución y acordará con el Banco los planes anuales de operación para cada uno de los proyectos.
La supervisión operativa y el planeamiento general estarán a cargo de un Consejo Supervisor que reportará directamente a la SCJ. La coordinación general administrativa de los diferentes proyectos corresponderá a un Coordinador General quien dirigirá la Unidad Coordinadora del Programa (UCP). La SCJ ha constituido una Unidad Coordinadora Técnica (UCT) para la preparación del Programa que sirve de base para conformar la UCP.
La ejecución y logro de objetivos y metas de cada uno de los tres proyectos será responsabilidad de Equipos de Proyecto, bajo la dirección de un Jefe de Proyecto, quien responderá al Consejo Supervisor.
Previo al primer desembolso, el Ejecutor deberá presentar evidencia al Banco de haber creado y puesto en funcionamiento la Unidad Ejecutora; y seleccionado y contratado los tres Jefes de Proyecto; y (e) evidencia de aprobación del primer Plan Operativo Anual.